Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO40Q9UH90 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO40Q9UH90 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO40Q9UH90 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms