Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNMT3BQ9UBC3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3BQ9UBC3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms