Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms