Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC43.74■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC43.74■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC43.73■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC43.69■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.69■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC43.69■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.66■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
CCDC180Q9P1Z9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC43.62■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC43.61■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC43.61■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
CCDC180Q9P1Z9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC43.6■■■■■ 4.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms