Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PHRF1Q9P1Y6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHRF1Q9P1Y6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms