Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCHIP1Q9P0W5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SCHIP1Q9P0W5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms