Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
KCMF1Q9P0J7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCMF1Q9P0J7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms