Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKIRAS2Q9NYR9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKIRAS2Q9NYR9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms