Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA8Q9NY65 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA8Q9NY65 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms