Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWK9

ZNHIT6, Box C/D snoRNA protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT6Q9NWK9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNHIT6Q9NWK9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms