Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TDP1Q9NUW8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDP1Q9NUW8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
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