Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXD4L1Q9NU39 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L1Q9NU39 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms