Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DEPPQ9NTK1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DEPPQ9NTK1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms