Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PDS5BQ9NTI5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PDS5BQ9NTI5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms