Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms