Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LTBP3Q9NS15 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBP3Q9NS15 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTBP3Q9NS15 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
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