Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNX15Q9NRS6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms