Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TULP4Q9NRJ4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TULP4Q9NRJ4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms