Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH2B1Q9NRF2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms