Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF3Q9NR81 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF3Q9NR81 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms