Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRT2Q9NQ03 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms