Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBN1Q9NPG3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms