Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ARFGAP3Q9NP61 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFGAP3Q9NP61 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms