Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUFT1Q9NNX1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUFT1Q9NNX1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms