Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PREBQ9HCU5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PREBQ9HCU5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms