Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM8AQ9HCN3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms