Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIPAS39Q9H9C1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VIPAS39Q9H9C1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VIPAS39Q9H9C1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VIPAS39Q9H9C1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VIPAS39Q9H9C1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VIPAS39Q9H9C1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VIPAS39Q9H9C1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms