Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNCQ9H7C4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNCQ9H7C4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms