Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf42Q9H799 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms