Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OPA3Q9H6K4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OPA3Q9H6K4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms