Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FNDC4Q9H6D8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FNDC4Q9H6D8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms