Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1DQ9H5J8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1DQ9H5J8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms