Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Z3

PCIF1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCIF1Q9H4Z3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCIF1Q9H4Z3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCIF1Q9H4Z3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms