Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIL1Q9H173 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIL1Q9H173 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIL1Q9H173 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIL1Q9H173 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIL1Q9H173 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIL1Q9H173 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIL1Q9H173 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIL1Q9H173 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIL1Q9H173 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIL1Q9H173 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIL1Q9H173 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIL1Q9H173 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SIL1Q9H173 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SIL1Q9H173 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIL1Q9H173 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIL1Q9H173 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIL1Q9H173 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms