Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSG1Q9H089 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms