Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I4

THSD7B, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7BQ9C0I4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THSD7BQ9C0I4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THSD7BQ9C0I4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms