Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTMR12Q9C0I1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTMR12Q9C0I1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms