Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZC3H12CQ9C0D7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZC3H12CQ9C0D7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms