Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCLK3Q9C098 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCLK3Q9C098 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms