Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
PCGF6Q9BYE7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PCGF6Q9BYE7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms