Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SCAPERQ9BY12 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SCAPERQ9BY12 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SCAPERQ9BY12 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SCAPERQ9BY12 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
SCAPERQ9BY12 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SCAPERQ9BY12 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SCAPERQ9BY12 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SCAPERQ9BY12 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SCAPERQ9BY12 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SCAPERQ9BY12 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SCAPERQ9BY12 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SCAPERQ9BY12 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SCAPERQ9BY12 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SCAPERQ9BY12 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SCAPERQ9BY12 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SCAPERQ9BY12 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SCAPERQ9BY12 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms