Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms