Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL3Q9BXA9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms