Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLVAPQ9BX97 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLVAPQ9BX97 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms