Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRIP1Q9BX63 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRIP1Q9BX63 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRIP1Q9BX63 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms