Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFAF3Q9BU61 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms