Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM208Q9BTX3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms