Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM42Q9BTD8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBM42Q9BTD8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms