Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDFIP1Q9BT67 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms