Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBGCP2Q9BSJ2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms